Joulukuu 2021, Tokion käräjäoikeus. Akihiro Eharaa syytetään naisen koskettelusta ruuhkaisessa junassa. Silminnäkijöiden videomateriaali hänen yrityksestä paeta tapahtumapaikalta ja sen jälkeisestä pidätyksestä on kaikkialla uutisissa, ja julkisuudessa vaaditaan enimmäisrangaistusta. Ehara ottaa esille yllättäen kesken oikeudenkäynnin rikoksen, joka tapahtui kolme päivää sitten Yokohamassa sijaitsevassa hylätyssä rakennuksessa, josta löydettiin kuollut ruumis. Olet etsivä Takayuki Yagami, joka saa tehtäväkseen selvittää rikoksen taustat ja tekijät yhdessä entisen yakuza kollegan Masaharu Kaiton kanssa. Uppoudu Tokion ja Yokohaman ruuhkaisiin keskuksiin ja kohtaa useita ryhmittymiä, joiden kanssa tulee helposti sanomista. Keskustele useiden eri ihmisten kanssa saadaksesi lisätietoa. Kiivaissa taisteluissa voit hyödyntää vastustajien energioita. Yagamin etsiväntaidot kasvavat matkan varrella mm. uusien laitteiden muodossa.